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Le Büchlein der ewigen Weisheit de Henri Suso, un ouvrage de dévotion et de méditation, date du XIVe siècle et est rédigé en dialecte alémanique. Meliora Muheim († 1630), qui devint plus tard prieure du couvent d'Hermetschwil, acquit le manuscrit sur parchemin auprès d'un relieur à Zurich en 1598 (Ir).
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Ce petit manuscrit en parchemin rédigé en latin date du XIVe siècle. Il se compose principalement d'un Compendium theologiae moralis en 224 chapitres consacrés aux concepts fondamentaux de la doctrine de la foi et de la conduite de la vie chrétienne. L'origine du manuscrit est inconnue.
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Ce manuscrit sur parchemin datant de la seconde moitié du XIIIe siècle est rédigé en latin. D'origine cistercienne, il appartenait depuis le XVIIIe siècle à l'ordre cistercien de Wettingen. Il comporte des corrections contemporaines, ainsi que des ajouts datant des XVe et XVIe siècles.
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Le manuscrit sur parchemin et papier date de la seconde moitié du XVe siècle et a été rédigé par le scribe Johannes dans le dialecte haut-alémanique. La mention de propriété a été effacée; l'hypothèse d'Albert Bruckner selon laquelle le manuscrit aurait appartenu à un couvent féminin n'est pas démontrée.
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La création du manuscrit liturgique sur parchemin date de différentes époques. La première partie a été écrite dans le dernier tiers du XIIIe siècle, tandis que la deuxième partie contient des ajouts datant des XIVe et XVe siècles. Le codex en latin appartenait à l'abbaye cistercienne de Chaalis, dans le nord de la France; au XVIIe siècle, il est devenu la propriété de l’abbaye cistercienne de Wettingen.
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Le Lectionarium officii est un manuscrit sur parchemin rédigé en latin après le milieu du XIIIe siècle. Son origine est inconnue, mais au XVIIe siècle, le codex est entré en possession de l'abbaye cistercienne de Wettingen.
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Le manuscrit en parchemin contient le Compendium theologicae veritatis de Hugues Ripelin (1210-1270) et les Quaestiones super quatuor libros sententiarum de Guilelmus Rothwell (vers 1260). Probablement conservé à Wettingen depuis le XVe siècle, le manuscrit appartenait au XVIIIe siècle à l'ordre cistercien de Wettingen.
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Le manuscrit, qui contient entre autres un plenarium en allemand ainsi que le traité Gegen den Eigenbesitz im Kloster de Heinrich von Langenstein, a probablement été relié à la fin du XVe siècle à la chartreuse de Bâle, où il a été conservé dans la bibliothèque des frères lais. Toutes les parties de ce codex ont été rédigées dans l’aire linguistique alémanique, la deuxième partie peut-être en Alsace. Il comporte des annotations du barbier de la chartreuse, un convers nommé Melcher, qui a notamment laissé des indications sur un cycle d’images des apôtres qui était prévu, mais qui n'a jamais été réalisé.
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Le recueil de textes médicaux contient, entre autres, une copie de l’Antidotarium Magnum, un riche compendium de recettes médicales, composé à l’initiative de Constantin l’Africain à Monte Cassino. Ce qui est remarquable dans cette copie c’est le décor de 22 grandes initiales, ornées et historiées.
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Le manuscrit contient le De disciplina scolarium du Pseudo-Boèce et le De compositis de Jean de Garlande, tous deux avec des commentaires et des ajouts. Ils ont été copiés au cours de la deuxième moitié du XVe siècle, et une partie est datée de 1498. L’ouvrage a été utilisé par plusieurs propriétaires qui y ont apporté de nombreuses annotations et corrections, dont des dessins simples à la plume, des exercices de versification et des noms d’élèves. Au début du XVIe siècle, le codex appartenait à la bibliothèque de la chartreuse à Bâle d’où il passa à la bibliothèque de l’université de Bâle après la Réforme.
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Ce recueil avec des vies de saints, des sermons et une petite collection de miracles mariaux, en allemand, a été composé à la fin du XIVe siècle dans la région linguistique de l'Alémanie orientale. La plupart des légendes remontent à la version allemande attribuée au dominicain zurichois Marquard Biberli (vers 1265 - vers 1330), qui n’est autrement transmise que dans le S 451 de Soleure. Le volume a été relié au plus tard au XVe siècle à partir de deux unités initialement indépendantes, chacune écrite par un scribe différent. La provenance médiévale du volume est inconnue ; au XVIIIe siècle, il appartenait à la « Bibliotheca Bruckeriana » (probablement Johann Heinrich Brucker, 1725-1754) et a été acheté par la bibliothèque universitaire en 1808.
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Dans cet acte, Charles IV (1314-1378, couronné empereur en 1355) autorise la comtesse Irmengard de Nassau († 1371) à percevoir des droits de passage dans ses villages, tribunaux et villes, comme le faisait son père Kraft II von Hohenlohe-Weikersheim († 1344) avant elle. Les recettes doivent servir à rembourser les dettes que l'Empire a envers elle. Attaché par une languette de parchemin au document, le sceau fragmentaire en cire est celui du roi Charles IV. Resté plusieurs siècles en possession de la famille Hohenlohe, le document est vendu par la maison J. A. Stargardt de Marbourg à Martin Bodmer en 1969.
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Composé de plus de 9’000 vers, le texte appartient à la première section du Divān de Jāmi, intitulée Fātihat al-shabāb (« L’Ouverture de la jeunesse »). Malgré son titre, ce manuscrit regroupe la poésie lyrique que Jāmi (1414-1494) composa depuis le début de sa carrière jusqu’à environ ses 65 ans, soit sur une période d’une trentaine d’années. Outre les poèmes mystiques et religieux, il contient également plusieurs panégyriques adressés à divers souverains dans lesquels le poète exprime sa gratitude ou célèbre leurs réalisations. Les peintures entretiennent un lien direct avec le texte.
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Graduel franciscain provenant du sud-ouest de l’Allemagne et datant de la première moitié du XIVe siècle. Richement enluminé d’initiales dans un style caractéristique du Haut-Rhin : grandes initiales à filigranes avec des médaillons représentant des animaux fabuleux. Reliure en bois recouverte de cuir brun foncé datant du XVIIIe siècle.
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Recueil de documents d'étude, rédigés pour la plupart par Jean Joly (gardien du couvent franciscain de Fribourg 1467-1469, 1472-1478, 1481-1510) pendant ses études à Avignon. En plus de nombreux textes d'étude de Jean Joly, il contient des écrits des franciscains Johannes de Fontanellis et Matteo d’Acquasparta. Reliure en bois recouverte de cuir brun due à l'atelier de Rolet Stoss dans le couvent franciscain de Fribourg, restaurée en 2020.
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Recueil compilé par Friedrich von Amberg (gardien au couvent franciscain à Fribourg, † 1432) à partir de différentes parties indépendantes les unes des autres et accompagnées de réclames. Le volume, divisé en dix parties, contient, outre des textes de prédication, des extraits de la Summa de vitiis de Guillaume Peyraut (partie 4), des Rationes XIV ad proficiendum in virtute de Ludolphe de Saxe (partie 5), des Moralia de Franciscus de Maironis (partie 7) et des Sermones de sanctis d'Engelbertus de Colonia (partie 10). Les feuilles de garde postérieures en parchemin contiennent un testament du XVe siècle, probablement établi en faveur des franciscains (N1v-N2r). Plusieurs onglets en parchemin, dont des fragments d'un manuscrit commenté du XIIIe/XIVe siècle, d'un traité de grammaire et d'un document, tous deux du XIVe siècle. Reliure à chaîne, recouverte de cuir fortement usé, restaurée en 2021.
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Le mince manuscrit, dans une reliure cartonnée recouverte en similicuir, contient un texte du père Moreau, De religione rauracorum, comme le rappelle l’étiquette collée sur son dos. Marcel Moreau (1735-1804), formé au collège des Jésuites de Porrentruy, puis entré à l’abbaye cistercienne de Lucelle, a écrit plusieurs textes sur l’histoire de sa région, notamment une série de six dissertations sur la Rauracie (A141). Le manuscrit A46 adopte cette même forme littéraire pour discuter du thème de la religion. Le texte principal, rédigé en latin avec quelques passages en français, occupe la partie gauche de chaque page et se trouve complété de notes diverses, ou de références bibliographiques, dans la partie droite. Il s’agit d’une copie de travail que l’auteur a visiblement corrigée, en biffant des mots, voire des parties entières, mais aussi en y apportant de nombreux ajouts.
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Datant de la fin du XVIIIe siècle, le manuscrit en papier contient un recueil des coutumes observées dans l’évêché de Bâle. Il est construit par entrées thématiques, telles que « commune, discussion volontaire, Grandval, obligations », etc., rangées suivant l’ordre alphabétique (d’« Absent », p. 1, à « Veuve », p. 255). Placé dans la marge latérale gauche, le terme relatif à chaque coutume est illustré par des extraits d’actes judiciaires, qui sont datés pour la plupart.
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Ce manuscrit en latin contient un abrégé de l’histoire de l’évêché de Bâle au temps de l’épiscopat de Jean-Henri d’Ostein (1628-1646), pendant la Guerre de Trente Ans. Le texte copié est identique à celui du manuscrit A1399a. Avant d’entrer dans le fonds de la bibliothèque du collège de Porrentruy (estampille sur la reliure en parchemin et sur une des pages de garde [V3]), cette copie a appartenu au chapelain Fidèle Ignace Chariatte (1730-1808) : Ex libris F. I. Charrialte sacellani M.G.V. 1766 (contreplat supérieur), puis à Henri-Joseph Crelier (1816-1889) : Ex libris Henrici Grelier 1841 (V1). Celui-ci, après une formation en théologie chez les Jésuites, est professeur au collège de Porrentruy, puis aumônier à Besançon, et enfin curé à Rebeuvelier, avant d’être révoqué en 1871.
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Ce manuscrit en latin contient un abrégé de l’histoire de l’évêché de Bâle au temps de l’épiscopat de Jean-Henri d’Ostein (1628-1646), identique à celui qui se trouve dans le manuscrit A1399. Cette copie a servi à l’édition française de Jean Trouillat, Les Suédois dans l’évêché de Bâle ou abrégé des faits qui se sont passés dans ce pays sous le gouvernement de Jean-Henri d’Ostein, Evêque de Bâle. Traduit sur l’original latin du P. Sudan, S.J. professeur au collège de Porrentruy, Porrentruy, Imprimerie typographique de J. Trouillat & Cie, 1862. Le père Claude Sudan (1579-1655), dont le nom a été ajouté bien plus tard sur la page de garde de ce manuscrit comme étant l’auteur de ce texte (p. V1), appartient à l’ordre des Jésuites. Formé en théologie et en philosophie, il professe à Fribourg, à Porrentruy, officie comme confesseur du prince-évêque de Bâle Jean-Henri d’Ostein (épiscopat 1629-1646), et rédige plusieurs ouvrages d’histoire. Très régulière, la copie du A1339a a été soigneusement relue et corrigée.
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